分子と分子の間に働く様々な相互作用を総括した用語。代表的な分子間相互作用には、静電相互作用、ファン・デル・ワールス相互作用、水素結合がある。また、水素原子とπ電子との相互作用、π電子間の相互作用、配位結合を介した相互作用、分子間の電子の移動に伴って生じる電荷移動相互作用も存在する。分子間相互作用は、分子やその集合体である液体や固体の性質を決定する要因となる。